杏林大學(xué)設(shè)有四個學(xué)部，分別為醫(yī)學(xué)部（醫(yī)學(xué)科）、保健學(xué)部（臨床檢查技術(shù)學(xué)科、健康福祉學(xué)科、看護(hù)學(xué)科、臨床工學(xué)科、緊急救護(hù)學(xué)科、理學(xué)療法學(xué)科）、綜合政策學(xué)部（綜合政策學(xué)科、企業(yè)經(jīng)營學(xué)科）、外國語學(xué)部。大學(xué)院設(shè)有醫(yī)學(xué)研究科（生理學(xué)系專攻、病理系專攻、社會醫(yī)學(xué)系專攻、內(nèi)科系專攻、外科系專攻）、保健學(xué)研究科（保健學(xué)專攻、看護(hù)學(xué)專攻）、國際協(xié)力研究科（國際開發(fā)專攻、國際文化交流專攻、國際醫(yī)療協(xié)力專攻、開發(fā)問題專攻），以及日本語研修課程。校長致辭（摘選）：21世紀(jì)，是必須以全球規(guī)模的眼光來考慮一切事物的時代。杏林大學(xué)正是立足于這個視點(diǎn)，不僅教授學(xué)生們學(xué)習(xí)各專業(yè)分野的知識，而且還要培養(yǎng)出可以以發(fā)展性的廣闊視野來思考，并且自律的人材。